Techniques de normalisation pour la quantification de marqueurs immunohistologiques
Encadrants : Raphaël Marée, Vannary Meas-Yedid
Email : Raphael.Maree@ulg.ac.be
Disponible : OUI
Nombre d'étudiants : 1
Description : Nous disposons d'une grande collection d'images histologiques 2D dans le
domaine de la néphrologie. Ces images montrent l'expression de
différents marqueurs (protéines) au sein de coupes de tissus de rein
transplantés ou pathologiques. Ces images présentent des variations de
coloration dûes aux protocoles expérimentaux qui rendent difficile la
quantification complètement automatique de ces marqueurs et la
détection de structures tissulaires.
Pré-requis : java
Travail demandé : Le but du projet est dans un premier temps d'implémenter des
algorithmes de normalisation/transfert de couleurs [Voir Références].
Il s'agira ensuite d'étudier l'influence de leurs paramètres et leur
impact pour la quantification de marqueurs au sein de coupes
(immuno)histologiques. Ces techniques seront ensuite évaluées pour
déterminer si elles améliorent la reconnaissance de différentes
structures tissulaires lorsqu'elles sont combinées avec des algorithmes
d'apprentissage.
Fichiers complémentaires : maree-isbi2014-final-preprint