Techniques de normalisation de couleurs pour la quantification de marqueurs immunohistologiques
Encadrants : Vannary Meas-Yedid
Email : vmeasyed@pasteur.fr
Disponible : OUI
Spécialité : IMA
Nombre d'étudiants : 1
Description : Nous disposons d'une grande collection d'images histologiques 2D. Ces images montrent l'expression de différents marqueurs (protéines) au sein de coupes de tissus sains ou pathologiques. Ces images présentent des variations de coloration dues aux protocoles expérimentaux qui rendent difficile la quantification complètement automatique de ces marqueurs et la détection de structures tissulaires.
Travail demandé : Quelques algorithmes de normalisation couleur ont déjà été implémentés sur notre plateforme de développement Icy : http://icy.bioimageanalysis.org/.
Après une étude bibliographique, le but du projet est d’implémenter un autre algorithme de normalisation couleur et d'étudier l’impact de ces algorithmes pour la quantification de marqueurs au sein de coupes histologiques. Ces techniques seront donc évaluées pour déterminer si elles améliorent ou non la reconnaissance de différentes structures tissulaires.
Programmation en java sur notre plateforme de développement Icy : http://icy.bioimageanalysis.org/
