Segmentation des cellules neuronale à l’aide de réseaux convolutionnels
Encadrants : Vannary Meas-Yedid
Email : vmeasyed@pasteur.fr
Disponible : OUI
Nombre d'étudiants : 1
Description : La segmentation précise des cellules est une étape essentielle pour caractériser leur forme. Ces dernières années, les réseaux profonds d’apprentissage ont montré leur efficacité et leur supériorité dans de nombreux domaines dont la segmentation d’image.
Travail demandé : L'objectif du projet est de faire un état de l’art sur les architectures de réseaux convolutionnels existant pour segmenter des cellules. Puis d’implémenter le réseau choisi pour détecter les cellules neuronales. Une attention particulière sera portée à la segmentation des cellules proches.
Jingru Yi, Pengxiang Wu, Menglin Jiang, Qiaoying Huang, Daniel J. Hoeppner, Dimitris N. Metaxas. Attentive neural cell instance segmentation. Medical Image Analysis 55 (2019). 228-240
