Modèles mixtes gaussiens pour la détection fine de spots en microscopie à fluorescence
Encadrants : Thibault Lagache
Email : thibault.lagache@pasteur.fr
Disponible : NON
Spécialité : Analyse d'images et modélisation mathématique
Nombre d'étudiants : 1
Description :
L’objectif de ce projet sera d’associer des modèles mixtes gaussiens à des algorithmes classiques de détection de spots fluorescents dans une image biologique (modèles basés ondelettes, déjà utilisés dans le laboratoire) afin d’affiner la détection et notamment quand les spots forment des petits clusters avec une taille sous résolutive.
Pré-requis : Bases d'analyse mathématique et de programmation java.
Travail demandé : A partir de la détection préalable des spots fluorescents par un algorithme basé ondelettes développé au sein du laboratoire, il s'agira d'identifier statistiquement le nombre et la position des spots "individuels" formant chaque "gros" spot préalablement détecté. Pour cela l'étudiant implémentera un modèle mixte Gaussien sur la plate-forme d'analyse d'images open-source Icy développée au sein du laboratoire (langage de programmation Java).
