Recalage rigide mono/multi modal de larges volumes 3D

Encadrants : Alexandre Dufour, Vannary Meas-Yedid
Disponible : OUI

Nombre d'étudiants : 1
Description :

Le but du stage est d’investiguer et implémenter une (ou plusieurs) méthode(s) de recalage rigide (Rigid Registration) 3D sur de très gros volumes d’images (typiquement 2k x 2k x 10k), soit de façon mono-modale (acquisitions en tomographie à rayons X dans différentes conditions expérimentales), soit de façon multi-modale (imagerie corrélative tomographie X / tomographie électronique). La solution implémentée doit être facile d’accès pour l’utilisateur final (via l’intégration dans le logiciel Icy). Un intérêt particulier sera apporté aux méthodes exploitant le calcul massivement parallèle (environnement HPC type CPU ou GPU). Langages possibles : Java, Julia, Python.
Références
– https://doi.org/10.1016/j.patrec.2009.03.015
– https://doi.org/10.1007/s11263-018-1067-5
– https://doi.org/10.1016/j.cag.2022.06.012

Pré-requis : Connaissances en Java et/ou Julia et/ou Python.
Connaissance du logiciel Icy est un plus
Travail demandé : Recherche bibliographique
Sélection et test d’une ou plusieurs méthodes
integration d’une ou plusieurs des méthodes retenues dans le logiciel Icy.
Liens complémentaires : https://icy.bioimageanalysis.org