Détection automatique de mitoses à partir d’images haut-contenu pour la gradation du cancer du sein en histopathologie numérique
Encadrants : Daniel Racoceanu - Bassem Ben Cheikh
Email : bassem.bencheikh@lib.upmc.fr
Disponible : OUI
Nombre d'étudiants : 1
Description : L’index mitotique est un des trois principaux éléments du système de Nottingham pour la détermination du grade histo-pronostique des cancers du sein. En routine clinique, la détermination de l'index mitotique se fait actuellement par comptage manuel du nombre de mitoses à partir de prélèvements tissulaires (biopsies). Grâce à l’histopathologie numérique, la détection et le comptage des figures mitotiques est devenu aujourd’hui possible. Le but de ce projet est d'étudier et d'implémenter la méthode décrite dans l'article dont le lien est donné plus bas.
Pré-requis : C++ / Méthodes de classification
Travail demandé : 1) Etude bibliographique: lire l'article et en faire une synthèse.
2) Implémenter la solution proposée en C++ (plusieurs modules qu’utilise la méthode sont déjà prêts à être utiliser).
3) Tester la méthode sur une base de données utilisée dans le contexte d’un concours international pour la détection de mitoses: http://mitos-atypia-14.grand-challenge.org/
Liens complémentaires : http://www.jpathinformatics.org/temp/JPatholInform4212-3346964_091749.pdf
