Analyse d’images de gliomes en pathologie digitale

Encadrants : Isabelle Bloch (LIP6), en collaboration avec l'ICM (Mehdi Touat, Franck Bielle, Julie Lerond)
Disponible : NON
Nombre d'étudiants : 1
Description :

L’analyse de gliomes (tumeurs du cerveau), la compréhension de leur évolution et la prédiction de leur réponse aux traitements passent par des biopsies tumorales et des images à l’échelle microscopique. Parmi les composantes importantes visibles sur de telles images, on s’intéressera aux noyaux des cellules (tumorales, immunitaires) et aux vaisseaux sanguins, qui sont des informations utiles à la caractérisation des tumeurs.

Pré-requis : bases d'analyse d'images et d'apprentissage
Travail demandé : 1. Etude bibliographique.
2. Mise en oeuvre d'une méthode de segmentation des noyaux de cellules et des vaisseaux sanguins. En fonction du temps disponible, il sera intéressant d'analyser la distribution spatiale des noyaux et leur répartition à proximité des vaisseaux.
Ce projet peut être proposé à un deuxième étudiant, en abordant directement l'analyse de la distribution spatiale à partir des coordonnées spatiales des cellules obtenues par une autre procédure.